交的时候，必不敢为患。襄阳是水陆之冲，御寇要害，不可弃。”不被听从。于是曹仁焚弃樊城、襄阳，孙权果然没有来犯，曹丕悔之。曹魏代汉后，以司马懿为尚书。不久，转督军、御史中丞，封安国乡侯。黄初二年（221年），迁侍中、尚书右仆射。
抵御孙吴
黄初七年（226年），曹丕逝世。孙权得知后，于八月出兵攻魏。命吴左将军诸葛瑾部兵分两路进攻襄阳，亲自率军进攻江夏郡。孙权一路为魏军所败，撤兵而走。司马懿击败诸葛瑾，并斩杀吴将张霸，斩首千余级。十二月，升任骠骑将军。
司马懿的军事才略还表现在孟达叛魏事件上。孟达原为蜀汉降将，曹丕命他守新城。曹丕死后，孟达欲叛魏归蜀。司马懿侦知消息后，一方面写信麻痹孟达，一方面遣军进讨，八日内行军一千二百里。孟达给诸葛亮信中认为司马氏率军来讨，至少需要一个月时间，所以当司马懿提前二十余日赶来时，完全打乱了他的叛乱计划。司马懿前后总共只用了十六日，即破上庸，斩杀孟达。
魏太和四年，曹魏派司马懿由西城，张合由子午道，曹真由斜谷，三路进攻汉中，诸葛亮率军西征，命李严率军2万赴汉中:44-45。合攻汉中，但因天雨而罢兵。
魏太和五年，春，诸葛亮第四次北伐。魏明帝让司马懿驻扎长安。诸葛亮先是围祁山，又招鲜卑轲比能响应。司马懿命令费曜、戴凌等留四千兵守上邽，其余兵力皆往祁山救援，司马懿亲率大军前往隃麋。就在司马懿以为诸葛亮主攻祁山时，不料诸葛亮却反其道而行，得知司马懿大军要来，分兵留攻祁山，自己却率主力奇袭上邽，迎击司马懿。郭淮、费曜等出击诸葛亮，却被诸葛亮大败。司马懿与诸葛亮遇于上邽之东，诸葛亮不断后撤将司马懿引诱至卤城祁山。司马懿既至，登山掘营，不肯战。军将领数次请战，司马懿都不准，被讥笑：“公畏蜀如虎，奈天下笑何！”，在众将的一再要求下，五月十八日，司马懿命袭击蜀将王平所部，却反遭诸葛亮逆袭，魏军为魏延、高翔、吴班等人所破，退保营寨。
六月，诸葛亮向汉中撤退，司马懿命张合率军追击，张合中箭身亡:235-236。
魏青龙二年四月，诸葛亮占据渭河南武功五丈原，想北渡渭河，被大将郭淮阻拦而失败。诸葛亮只能在渭河南与魏国大都督司马懿对峙。由于战术上的败势，司马懿据险坚守，对峙百余日后，蜀军粮尽而自退。诸葛亮曾多次向司马懿挑战。司马懿写奏章向魏明帝请战，明帝下令不许出战，并派卫尉辛毗持符节制止魏军:241。姜维对诸葛亮说：“辛佐治仗节而到，贼不复出矣。”诸葛亮说：“彼本无战情，所以固请战者，以示武于其众耳。将在军，君命有所不受，苟能制吾，岂千里而请战邪！”诸葛亮再派人至司马懿军中，司马懿只向汉使询问诸葛亮寝食和管理政事的繁杂，不过问军旅之事。诸葛亮使者对司马懿说：“诸葛公夙兴夜寐，罚二十以上，皆亲揽焉；所啖食不至三升。”司马懿说：“亮将死矣。”其后，两军对峙一百多天。诸葛亮的北伐都以失败告终。八月，诸葛亮终于病倒:242。刘禅派尚书仆射李福到前线去探望，回到成都时，诸葛亮在五丈原前线病逝，享年五十四岁。当杨仪等人整军而还时，司马懿得知蜀汉撤退，亲自率兵来追；姜维见司马懿追来，反旗鸣鼓，司马懿不知诸葛亮已死，下令停止追击，全军返回:250。于是杨仪结阵而去，从容退进斜谷，百姓流传一谚语：“死诸葛惊走生仲达。”:250司马懿听到后，说：“吾能料生，不便料死也。”:250（我能预料他活着的时候想做什么，不能预料他死后想怎么做。）司马懿到诸葛亮驻军营垒处所察看，感叹说：“真是天下的奇才啊！”。追到赤岸，没有追上蜀军而退军。此后，司马懿成为曹魏政权的中流砥柱，地位日益提高。次年正月戊子日（235年2月13日）升迁为太尉。
【青龙五年（237年），原魏辽东太守公孙渊自立为燕王，置列百官，对抗朝廷。景初二年（238年）正月，魏明帝曹叡遣59岁的司马懿率军4万，前往征讨，途中司马懿路过故乡温县，会见父老乡亲，感慨万千，做诗一首：“天地开辟啊曹魏代汉，如同日月重新放射出光芒。皇上赐给我绝佳的机会啊，让我仗剑讨伐远方。横扫叛贼公孙渊，路过我可爱的家乡。铲除疆域中的一切敌人，还遭受生灵涂炭的百姓以稳定和安宁。大功告成我将请辞告老，听候皇上发落，让我在舞阳颐养。”六月进至辽水。】
【公孙渊急令大将军卑衍、杨祚等人率步骑数万，依辽水围堑20余里，坚壁高垒，阻击魏军。司马懿采用声东击西之计，佯攻围堑，而以主力隐蔽渡过辽水，直取公孙渊根据地襄平，迫使敌军放弃围堑回军救援襄平。司马懿督军回首山，迎战敌援军，三战皆捷，遂乘胜进围襄平】
【当初公孙渊闻魏军来攻，曾求救于孙权，孙权也出兵为其声援，并写信给公孙渊说：“司马懿善用兵所向无前，深为弟忧也。”】
【适逢连降大雨，
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